Події в «Аномалії» починаються з загадкової смерті видатного науковця, доктора Александера Бунге, який був одним з головних учасників експериментів, що стосувалися виявлення гравітаційної аномалії в кристалах. Його смерть відразу ставить у центр уваги читача наукову загадку, яка буде розгадуватися протягом усього роману. Чи є його вбивство результатом якихось злочинних маніпуляцій, чи, можливо, він став жертвою тієї ж самої аномалії, яку досліджував? Саме це питання відкриває перед читачем головну інтригу книги.
Агент спецслужб Маркус Бруннер, який починає розслідування смерті науковця, ставить собі за мету розкрити, що ж насправді сталося. Його пошуки, сповнені несподіваних поворотів, поступово призводять до більш глобальної таємниці, що пов'язана з науковими дослідженнями і зовсім неочевидними наслідками для майбутнього людства.
